A Sede da Apampesp em Araraquara foi instalada no dia 12 de fevereiro de 1996 e contou com a presença da Professora Zilda Halben Guerra, então presidente da Entidade, que se dirigiu aos presentes conclamando-os para a luta em defesa do professor Aposentado. Era grande o número de sócios e de representantes das entidades, inclusive de outras cidades como São Paulo, Ribeirão Preto, Campinas e São José do Rio Pardo.  A sede funcionou em vários endereços até adquirir sua sede própria, na Av. Osório nº 90 nas salas 503, 504 e 505.

A primeira diretoria da Regional de Araraquara era presidida pelo Prof. Walter Lopes, que respondeu pela regional até o ano de 2000, com algumas alterações no quadro da diretoria. Desde 2001, a Regional é dirigida pela Profª Aracy Dias Mendes, reeleita no último ano para mais um mandato de 3 anos.