O então Escritório Regional foi desmembrado da Sede Regional de Fernandópolis em 12 de abril de 2002, ocasião em que foi eleita a sua primeira diretoria provisória e instalado em 2 de outubro do mesmo ano, na sala 603 do Edifício Rui Barbosa, na área central da cidade.

Em sua história, a Sede Regional de São José de Rio Preto já teve como dirigentes as professoras Margarete Monteiro Bartholo Brizoti e Clarice Aparecida Caparroz Borges.

A atual diretoria está composta pelas professoras Elisabel Pinoti Suzano Pascon, como dirigente regional; Solange Márcia Pastorelli Pedraza, como vice-dirigente; e Maria Gorete Priólli Daniel, como tesoureira.

A sede abrange 33 municípios, além da cidade-sede, são elas: Adolfo, Bady Bassit, Bálsamo, Cajobi, Catanduva, Cedral, Fernando Prestes, Guapiaçu, Ibirá, Jaci, José Bonifácio, Macaubal, Mendonça, Mirassol, Monte Aprazível, Neves Paulista, Nova Aliança, Nova Granada, Nova Itapirema, Novo Horizonte, Olímpia, Palestina, Planalto, Poloni, Potirendaba, Santa Adélia, Severina, Tanabi, Tabapuã, Ubarana, Uchoa e Urupês.